中华人民共和国呼和浩特海关地处内蒙古自治区首府呼和浩特市，是直属国家海关总署的正局级海关，呼和浩特海关关区面积72万平方公里，边境线长2400多公里，业务管辖范围包括内蒙古自治区中西部的呼和浩特市、包头市、乌海市、鄂尔多斯市和锡林郭勒盟、乌兰察布盟、巴彦淖尔盟、阿拉善盟共8个盟（市）。
目前关区辟有呼和浩特国际航空港、二连浩特铁路、公路三个长期开放的口岸和珠恩嘎达布其、策克、甘其毛道三个中蒙季节性过货口岸。现呼和浩特海关下设副（厅）局级机构2个，正处级机构20个，副处级机构4个。内设机构有：办公室、通关管理和技术处、征统处、思想政治工作办公室、监察审计室；派驻机构有：现场业务处；隶书海关有：二连海关（1956年1月1日开关）、包头海关（1997年7月18日开关）；事业单位有：机关服务中心。走私犯罪侦查分局下设二连支局、包头支局。现关区在册员工305人，其中呼关84人，二连海关134人，包头海关32人，侦查分局55人。大专以上学历261人，本科以上学历143人。地处经济文化相对落后的边疆少数民族地区，点多线长、监管区域较广是呼和浩特海关业务工作的显著特点。建关以来，在海关总署的正确领导和地方党政部门的大力支持下，呼和浩特海关坚持“依法行政，为国把关，服务经济，促进发展”的海关业务指导思想，大力加强队伍及业务建设，积极采取各种措施服务经济，促进发展，关区业务建设取得了稳步的推进和发展。目前我关监管的贸易方式已包括一般贸易、加工贸易、边境小额贸易、边民互市贸易等多种类型，监管的部门也涵盖了货管、旅检、保税、邮检、稽查、免税品等较为齐全的业务门类。
1991年7月至2001年4月，呼和浩特海关累计监管进出境货物1100万吨，货值42亿美元；监管进出境人员508万人次；征收关税、代征税21亿元人民币；查缉走私违规案件464起，案值5.6亿元人民币，为国家和自治区对外贸易的发展和边疆少数民族地区的繁荣发展作出了积极的贡献。
