满洲里海关历史悠久，是我国最早设立的海关之一。在建国初期满洲里口岸作为中苏贸易的主动脉，地位和作用十分重要。进出口货运量一直居于全国前列，对国民经济的恢复及国家第一个五年计划的完成做出了重要贡献。继1985年满洲里市被国家定为甲级开放城市之后，1992年又被国务院批准为首批沿边开放城市。满洲里海关业务量急剧扩大，监管方式也由国际铁路联运向铁路、公路、水运、航空等全方位扩展，单一的国家贸易发展成为国贸、地贸、边贸、劳务合作、承包工程等多种贸易方式并存的繁荣局面，所辖口岸也由原来仅有的铁路和公路口岸发展为黑山头、室韦、阿日哈沙特等10个口岸。
近几年，满洲里海关监管进出口货物量一直在300万吨以上，2000年更是突破历史新高，达594.95万吨。其中满洲里铁路口岸进出口贸易值占中俄贸易值的30%左右，成为中俄贸易最大的通商口岸。
多年来，满洲里海关始终坚持从严治关，力争造就一支高素质的海关队伍，以高素质的人才高质量地完成各项工作。同时，不断挖掘内部潜力，加大科技投入，结合口岸实际，自行编制相关程序，建设安装了世界首台H986货运列车在线检查系统。为加快通关速度，改善通关环境奠定了坚实的基础。
在新的世纪，满洲里海关将更好地肩负起自己的职责和使命，在海关总署的领导下，正确处理“依法行政，为国把关”与“服务经济，促进发展”的关系，团结开拓，继往开来，使各项工作再上新的台阶。
