北京海关目前共有关员和缉私警察一千余人，业务管辖范围是北京市（包括市区和所有郊区县）。负责对北京地区进出境运输工具、货物、旅客行李物品和邮递物品的监督管理，征收关税和其他税费，查缉走私，编制海关统计。
在货运监管方面，北京海关以首都机场、京津塘高速公路和北京铁路枢纽为依托，建立了空运、海运、陆运监管通道。年监管货物140多万吨，集装箱2万多箱。近年积极向国际惯例靠拢，改革通关制度，先后推出 H883自动化报关、口岸直通式监管模式、EDI快件及普货通关系统，开通与16家大型企业的无纸报关联网等一系列改革措施，大大提高了通关效率。
在旅客行李物品监管方面，为适应进出境旅客逐年大幅度递增的形势要求，保证在旅检工作中监管与方便相统一，北京海关从80年代中期即开始在空运旅检工作中实行了《京都公约》F3附约中规定的红、绿通道制度，从而大大地加快了旅客通关速度，给进出境旅客提供了便利。近年年验放进出境旅客一直保持在500万人次以上。
北京海关邮递物品监管量居全国海关首位，年验放邮递物品近4000万件，进出境印刷品3600余万件。1995年邮检自动化系统正式启用，结束了北京海关邮递物品监管手工操作的历史，使邮检工作达到全国领先水平。
在税收征管上，北京海关坚持依率计征，依法治税，现场征税与事后重点稽查相结合。改革开放以来，税收年均递增39.7%，从1999年开始，年税收超过100亿元。
近年来，加工贸易监管合同备案数以每年20%递增，年备案合同达5000余份，逐步形成了多层次、多领域的保税业务监管体系。99年在北京海关备案的加工贸易企业有800多家，寄售维修保税仓库和其它备料、备件保税库200多家。
北京海关每年要完成30余万份报关单的统计任务，统计内容包括进出口货物、品种、商量、价值、国别等项目。近年来统计工作制度进一步科学化，实行了计算机检控，统计数据质量达到较高水平，同时，还定期向市政府及其它部门提供统计数据资料和统计分析报告，为宏观决策服务。
北京海关不断加大打击走私工作力度，逐步实现缉私装备现代化、缉私手段科学化、缉私力量智能化。针对关区查私特点，积极有效地开展打私专项斗争，成效明显，查获走私千万元以上大案的数量逐年增加，年罚没收入达8000万元以上，沉重打击了走私犯罪行为。
北京海关坚持从严治关，狠抓队伍建设，加强廉政建设，实行干部交流制度和公务回避制度，强化竞争激励机制，大力推进人事制度改革。不断改进态度作风，优化作业程序，积极开展创建"文明窗口"活动，大力推进精神文明建设。先后有多个单位获得各级机关的表彰和嘉奖。
